La tecnologia ti consente di rilevare virus da scoprire

La teoria qui è relativamente semplice, è vero. Tuttavia, lo stesso non si può dire della tecnica necessaria per farlo. Ecco l'idea: una nuova tecnologia sviluppata dai ricercatori dell'Università di Saint Louis è in grado di identificare virus non scoperti all'interno di un organismo.

È pura e semplice aritmetica, in effetti. Innanzitutto, viene raccolto un campione di sangue. Quindi l'intera sequenza genetica umana viene sottratta dalla struttura, lasciando solo il materiale virale. Ecco come funziona tutto quando lo guardi in dettaglio - come spiegato dal presidente del Dipartimento di Medicina Interna dell'istituzione, Adrian Di Bisceglie:

"Isoliamo il DNA e l'RNA, amplificiamo il materiale genetico nel sangue, eseguiamo il sequenziamento profondo e utilizziamo un algoritmo di ricerca per trovare somiglianze con tutti i bit di codice conosciuti, sia dall'uomo che dai microbi. "

L'amplificazione è un po 'più complicata

Come sottolinea il ricercatore Xiaofeng Fan, mentre il processo è teoricamente facile da comprendere, la grande sfida era trovare un modo per valutare correttamente il materiale lasciato in un campione di sangue - presumibilmente con il codice genetico del virus ricercato.

Fonte immagine: riproduzione / CNET

Questo perché l'RNA si degrada molto rapidamente, il che ha reso impossibile l'identificazione mediante campioni di sangue, poiché la quantità era troppo piccola. Amplificando il materiale genetico, tuttavia, le dimensioni relativamente ridotte non rappresentano più un impedimento.

Animali difficili da domare

Non è oggi che i virus offrano numerose sfide alla comunità scientifica. Come ricorda il sito web CNET, anche quando l'infezione virale è brevettata, ci sono ancora molte difficoltà a capire quale virus lo spiega specificamente.

Fino ad oggi, l'approccio standard richiedeva la raccolta di campioni per successive coltivazioni in laboratorio. Tuttavia, esiste una limitazione molto evidente alla procedura: si deve conoscere esattamente il virus a cui è stato esposto il donatore del materiale. Infine, c'è anche la questione del tempo: è una procedura relativamente lunga.

Ma vale la pena dire: la raccolta di materiali genetici virali non è nuova. Tuttavia, a differenza di altri metodi, la cosiddetta "sottrazione del trascrittoma" offre l'ovvio vantaggio di rilevare e identificare anche virus ancora sconosciuti all'umanità, in quanto è possibile confrontare le sequenze genetiche presenti nei database.

tempestivo

La tecnica della "sottrazione del trascrittoma" potrebbe essere arrivata in un momento molto appropriato. Dopotutto, in questo momento, un virus simile alla SARS sta iniziando a preoccupare l'Arabia Saudita - ha già raccolto alcune decine di persone lì.

Tuttavia, oltre l'obiettivo immediato, i ricercatori coinvolti nella tecnica ritengono che sia un'opportunità unica per conoscere il viroma tipico dell'organismo umano.

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"Proprio come i progetti di microbiomi hanno registrato i batteri che vivono e coesistono in ogni persona, stiamo anche studiando il viroma umano al fine di conoscere meglio i virus che esistono in tutti noi", ha detto Di Bisceglie. "Riteniamo che non tutti siano dannosi e che alcuni di essi possano addirittura essere utili."

L'Università di Saint Louis ha appena brevettato la nuova tecnica e sta attualmente cercando la commercializzazione.